一种新的RNA二级结构三维图形表示及其应用

摘要：

本研究提出了一种新的RNA二级结构的图形表示方法,这种方法不同于以往的表示方式.根据所提出的RNA二级结构的图形表示,将对9种病毒的RNA二级结构进行图形表示,构建系统进化树,进行序列间相似性的比较和分析.根据最终结果,可以很清晰地发现,AVII与LRMV两种病毒是最为相似的,另外,较大的距离值出现在了APMV与ALMV;PDV与AVII中,这说明这几种RNA二级结构明显不相似.这一研究结果与前人相似性分析的结果是十分相似的,同时,所采取的方法更加简单易于区分观察且得到的结果又是十分可靠的,因此,这些更加证明了该方法是有效的.

关键词：RNA二级结构、图形表示、系统进化树、相似性

所属期刊栏目：15

分类号：Q522(核酸)

资助基金：辽宁省教育厅科学研究一般项目L 2015093

在线出版日期：2017-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：55-58