重组琼胶酶rAgaN3基因的生物信息学分析

摘要：

利用生物信息学软件和数据库对从Microbulbifer sp.BN中得到的琼胶酶rAgaN3全长基因进行预测分析,结果表明:重组琼胶酶 rAgaN3理论分子量为31.243 kDa,理论等电为4.81,不稳定系数为26.23,脂肪系数为62.35,平均疏水性系数为-0.662,无跨膜结构域,无信号肽;二级结构表明该蛋白无螺旋结构,有15个折叠结构,其余均为卷曲结构;序列相似性分析表明,蛋白rAgaN3属于糖苷水解酶GH16家族,为β-琼胶酶;以同源蛋白3wz1A(同源性88%)为模板,通过同源建模构建出了蛋白三级结构,并用拉式图进行了结构检验.琼胶酶rAgaN3基因的生物信息学分析,为琼胶酶的异源表达提供了指导,为琼胶酶的定点突变、深入研究其结构和功能的关系打下良好基础.

关键词：琼胶酶、基因分析、生物信息学、蛋白结构

所属期刊栏目：15

分类号：Q55(酶)

资助基金：福建省企业技术创新项目闽经信投资[2015]205号;福州市科技计划项目2016-G-42

在线出版日期：2017-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：16-26