甜瓜蔗糖转化酶基因的密码子偏好性分析

摘要：

以甜瓜蔗糖转化酶基因序列为材料,研究甜瓜蔗糖转化酶基因密码子偏好性,为改良甜瓜风味与品质提供理论依据.运用在线分析软件CodonW对甜瓜蔗糖转化酶的编码序列(Coding sequence,CDS)进行密码子分析,利用Mobyle在线工具分析同义密码子相对使用度(RSCU)、有效密码子数(ENC)、GC及GC1s、GC2s、G C3s含量.甜瓜蔗糖转化酶基因偏好于以A或T结尾的密码子.密码子ATT、GTT和AGA的RSCU值都大于1,属于共同偏好使用的密码子,而密码子GCG、CGG的RSCU值小于1,属于使用频率较低的密码子.发现密码子偏好性与亲缘关系的远近有一定的关系.要实现目的基因在外源表达系统中的成功表达和提高其表达量,可通过增加目的基因剂量,目的基因密码子优化,改善培养条件等方法实现,其中目的基因密码子优化起到了关键作用.

关键词：甜瓜、蔗糖转化酶、密码子偏好性

分类号：S652;Q343.1+2(瓜果园艺)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31260258

在线出版日期：2016-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：71-77