四种常用的生物序列比对软件比较

摘要：

随着高通量测序技术的快速发展，下一代测序技术也迅速发展为生物领域中的主流技术，而理解下一代测序数据最重要的一步是比对。比对是进行后续生物信息分析的基石，也因此催生了很多比对软件。本文主要选取了四种常用的比对软件Bowtie2、BWA、MAQ和SOAP2，对这四种软件及算法进行综述，并通过实际测序数据对四种软件进行比较和评估，为生物学研究者选择最佳的短序列比对软件提供理论和实践依据。

关键词：下一代高通量测序、比对软件、生物信息

所属期刊栏目：14

分类号：Q-31(生物科学的研究方法与技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目U1301252。

在线出版日期：2016-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：56-60