鸟胞内分枝杆菌mmpL11同源基因序列分析及功能预测

摘要：

以非结核分枝杆菌中的胞分枝杆菌、鸟分枝杆菌两个标准株为研究对象，以耻垢分枝杆菌mc2155和结核分枝杆菌H37Rv为对照，对其mmpL11同源基因进行序列分析，并对其蛋白质进行结构及功能预测，为后期的抗酸染色阳性菌诊断，药物靶标的筛选提供理论基础。根据同源比对找到两个标准株的mmpL11同源基因；应用expasy工具预测MmpL11同源蛋白理化性质；蛋白质信号肽预测采用SignalP在线软件进行预测；使用TMHMM在线工具进行拓扑结构预测；利用Interproscan工具对蛋白保守序列和功能进行预测；使用SSpro对蛋白二级结构进行预测。 OCU48920蛋白的理化性质分析显示：其氨基酸个数为1018，分子量为108．4 kD，理论等电点为7．61，疏水指数为0．227；MAP3637c蛋白的理化性质分析显示：其氨基酸个数为1007，分子量为107．2 kD，理论等电点为8．59，疏水指数为0．231。信号肽预测发现两个标准株的MmpL11均不存在信号肽切割位点，未发现信号肽存在。跨膜预测发现其跨膜次数分别为12和12肽链，N端均在膜内，二级结构以α－螺旋和β－片层为主。保守序列预测发现两个标准株的 MmpL11蛋白均有两个 MMPL 跨膜结构域，一个固醇敏感多肽区。 OCU48920、MAP3637c为H37Rv的MmpL11同源蛋白，推测其功能同MmpL11相似，是分枝菌酸的转运蛋白，参与胞内小分子的运输和信号转导。

关键词：非结核分枝杆菌、MmpL11、序列分析、功能预测

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分类号：Q93(微生物学)

资助基金：武汉轻工大学研究生创新基金项目2014cx019。

在线出版日期：2016-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：7-12