基于位置权重矩阵的核小体识别及功能分析

摘要：

为研究高通量的人类CD4＋T细胞的核小体定位模式，使用迭代算法对核小体定位模式进行分类，并利用位置权重矩阵方法分别构建稳定核小体定位序列、动态核小体定位序列和连接区序列模型，通过十倍交叉验证评估模型性能，并与Segal方法与弯曲度方法进行比较，发现位置权重矩阵方法在敏感性、精度和准确性方面都具有一定优越性。同时采用滑窗法在全基因组选取候选序列进行核小体识别，挖掘核小体定位相关基因，并进行基因生物学进程功能富集分析，发现稳定与动态核小体、真实与潜在核小体对应的基因所参与调控的生物学过程各有不同，但也有一些生物学过程为不同类别核小体所共有，例如对细胞内大分子的调控功能。

关键词：核小体定位、位置权重矩阵、基因功能富集分析

所属期刊栏目：14

分类号：Q523(核酸)

资助基金：黑龙江省卫生厅科研课题资助2013129。

在线出版日期：2016-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6