结合分子相似性、药效团和分子对接筛选新的HIV-1蛋白酶抑制剂

摘要：

结合分子相似性、药效团和分子对接建立兼顾计算效率和预测准确度的HIV?1蛋白酶抑制剂筛选方法。首先通过对现有HIV?1蛋白酶抑制剂分子进行相似性分析，选取代表性的HIV?1蛋白酶抑制剂作为模板分子，构建和优化药效团模型，并从1万个化合物中优先筛选出500个化合物。而后采用分子对接方法进一步考察化合物与HIV?1蛋白酶结合情况，得到4个新的活性候选化合物，并进行其结合自由能计算和抗突变性分析。结果表明新候选化合物ST025723和HIV?1蛋白酶表现出较好的相互作用和抗突变性，具有深入研究的价值，同时也证明分子相似性、药效团和分子对接相结合能够快速有效地发现新颖活性候选化合物。

关键词：HIV-1蛋白酶抑制剂、分子相似性、药效团、分子对接

分类号：R91(药物基础科学)

在线出版日期：2016-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：244-250