基于氨基酸约化和统计特征的蛋白质亚细胞定位预测

摘要：

蛋白质亚细胞定位预测对蛋白质的功能、相互作用及调控机制的研究具有重要意义。本文基于物化性质和结构性质对氨基酸的约化，描述序列局部和全局信息的“组成”、“转换”和“分布”特征，并利用氨基酸亲疏水性的数值统计特征，提出了一种新的蛋白质特征表示方法（ NSBH）。分别使用三种分类器KNN、SVM及BP神经网络进行蛋白质亚细胞定位预测，比较了几种方法和特征融合方法的预测结果，显示融合特征表示及结合SVM分类器时能够达到更好的预测准确率。同时，还详细讨论了不同参数对实验结果的影响，具体的实验及比较结果显示了该方法的有效性。

关键词：蛋白质亚细胞定位、氨基酸物化性质、支持向量机

分类号：Q811(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然基金项目61272312资助。

在线出版日期：2015-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：103-110