基于EST数据的水稻基因表达大规模初步分析

摘要：

EST序列代表了组织基因表达的转录信号，本研究尝试开发简单高效的大规模EST分析方法，从NCBI下载水稻（Oryza sativa）的所有EST序列并进行分析以获取水稻发育过程基因表达的重要信息。通过进行blast比对和phrap拼接分析，及利用Unix文本过滤方法，从EST序列拼接获得了3万多个重叠群序列。进一步将重叠群序列与NCBI核酸数据库进行比对获得了各个序列的注释信息。从重叠群的组织表达初步挖掘中发现花药的表达数量最多，为下一步探讨水稻发育器官特异表达基因调控打下了重要基础。

关键词：水稻、EST、Bast、Phrap、组织特异表达

分类号：Q344+.13(遗传学分支学科)

在线出版日期：2015-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：96-102