基于PDB数据库的三个RNA二级结构预测软件评估

摘要：

随着21世纪分子生物学研究的蓬勃发展，RNA二级结构预测成为其中一项重要内容。由于RNA二级结构预测的准确性最为关键，因此寻找高精度且易操作的二级结构预测工具显得非常重要。本文选取三种简单且易操作的二级结构预测软件，先基于PDB数据库收录的318个RNA发夹序列进行二级结构预测，进而通过比较预测结果与实验测定结果进行软件预测性能评估。比较结果显示，RNAstructure为三个软件中性能最优的RNA二级结构预测软件。

关键词：RNA二级结构、PDB数据库、二级结构预测、准确性

分类号：Q74(生物小分子的结构和功能)

资助基金：国家自然科学基金青年项目31301388；中国博士后面上项目2014M562109；湖南省自然科学基金14JJ3092；湖南省科学技术厅科技计划项目2014GK3046；湖南农业大学大学生科技创新基金团委资助科研项目18；湖南农业大学植物保护学院＂大学生创新性实验计划项目 SAY1106。

在线出版日期：2015-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：35-39