人线粒体转录终止因子1（hMTERF1）蛋白的生物信息学分析

摘要：

为了预测和分析人线粒体转录终止因子1（ human mitochondrial transcription termination factor 1， hMTERF1）蛋白的结构与功能。采用生物信息学的方法对hMTERF1进行系统的分析与研究，包括hMTERF1的理化性质、跨膜区和信号肽、亚细胞定位、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模。结果表明：hMTERF1蛋白分子量为45．78 kD，等电点为9．49，不具有信号肽和跨膜区。该蛋白定位于细胞线粒体，N端1～57个氨基酸为前导肽序列。其二级结构主要为a螺旋和无规则卷曲，包含6个MTERF基序，三级结构显示结果与二级结构预测结果相符。蛋白质多重序列比对和聚类分析显示，hMTERF1蛋白与黑猩猩、大鼠、小鼠等哺乳动物的MTERF1蛋白具有高度同源性，在系统发育树上聚为一簇。 hMTERF1的生物信息学分析为进一步探索hMTERF1蛋白的功能提供参考资料和理论依据。

关键词：人类、线粒体转录终止因子1、蛋白质、结构、生物信息学

分类号：Q518.2;Q811.4(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金项目31260276；云南省教育厅科学研究重点项目2014Z126；云南省昆虫生物医药研发重点实验室开放课题201409；大理学院博士科研启动基金项目BSKY2012018；云南省大学生创新创业计划项目201408。

在线出版日期：2015-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：23-30