基于Bioperl实现远程自动获取抗逆基因序列

摘要：

BioPerl对于现今大量的生物数据来说，具有很好的获取和处理能力，并且NCBI提供了可以直接访问它下属的 Entrez数据库（包括 PubMed）的编程接口，即E-Utilities。为了从NCBI中自动获取大量抗逆基因序列，使得生物抗逆基因二次数据库得以搭建，该文基于BioPerl 设计了远程自动获取大量抗逆基因序列的程序。此程序灵巧、精悍， Perl 语言强大的文本处理功能使程序能实现不同类型基因序列的远程获取。

关键词：BioPerl、E-Utilities、远程自动获取、抗逆基因

分类号：Q343.1(遗传学分支学科)

资助基金：自治区自然科学基金2010211022；新疆师范大学研究生科技创新基金20131203资助。

在线出版日期：2014-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：185-188