高通量DNA甲基化数据的处理和分析方法

摘要：

DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处理和分析是当前亟需解决的问题.在本文中,总结了目前存在的三种高通量DNA甲基化检测技术(限制性内切酶法,亲和纯化法,重亚硫酸盐转换法),以及针对这些技术产生的高通量数据开发的存储、处理和分析工具.另外,还注重介绍了单碱基水平的DNA甲基化检测技术,BS-Seq的测序原理、数据处理流程以及后续的分析工具.

关键词：DNA甲基化、高通量、二代测序、BS-Seq

所属期刊栏目：12

分类号：N37(数据处理)

资助基金：黑龙江省大学生创新创业训练计划201210226018;国家自然基金青年项目61203262

在线出版日期：2014-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：72-76