甘蔗细胞色素C基因的电子克隆与分析

摘要：

以甘蔗类似细胞色素C的EST序列CF576943.1为探针,通过电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素C基因(Cytochrome C,Cyt C)的一条cDNA全长序列,命名为ScCyt C.用生物信息学方法对该基因氨基酸序列与组成、亚细胞定位、跨膜区与信号肽、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构以及功能等进行分析与预测.结果表明:Cyt C基因全长1 073 bp,编码112个氨基酸,该基因位于细胞质,为非分泌型蛋白,无规卷曲为主要二级结构原件,含有1个保守功能域,主要功能为翻译并且在不同植物中具有高度保守性.电子表达分析结果显示,该基因在甘蔗各个组织均有表达,其中在茎和根中的表达量比其他组织类型中表达量高,此外,该基因的表达可能受到低温的调控.为甘蔗细胞色素C基因的结构及其功能的研究奠定了一定的基础.

关键词：甘蔗、Cyt C基因、电子克隆、生物信息学、电子表达分析

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分类号：TS242.1;Q753(食品工业)

资助基金：国家自然科学基金31340060;教育部博士点基金20103515120006;福建农林大学杰出青年基金xjq201202

在线出版日期：2014-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：10-17