利用伪氨基酸组分和支持向量机预测抗冻蛋白

摘要：

抗冻蛋白是一类具有提高生物抗冻能力的蛋白质.抗冻蛋白能够特异性的与冰晶相结合,进而阻止体液内冰核的形成与生长.因此,对抗冻蛋白的生物信息学研究对生物工程发展,提高作物抗冻性有重要的推动作用.本文采用由400条抗冻蛋白序列和400条非抗冻蛋白序列构成数据集,以伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测抗冻蛋白,对训练集预测精度达到91.3％,对测试集预测精度达到78.8％.该结果证明伪氨基酸组分能够很好的反映抗冻蛋白特性,并能够用于预测抗冻蛋白.

关键词：抗冻蛋白、伪氨基酸组分、支持向量机

所属期刊栏目：11

分类号：Q753(分子遗传学)

资助基金：内蒙古科技大学青年创新基金2011NCL048

在线出版日期：2014-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：297-299