珍珠鸟(Taeniopygia guttata)小染色体基因表达的密码子偏性

摘要：

从NCBI数据库(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/mapview/map)下载珍珠鸟全部小染色体基因的cDNA序列,最终共有l 586个基因的CDS序列纳入统计分析.密码子的偏性分析使用CodonW (1.4.2)完成,初步确定了UUC、UCC、UCG等27个密码子为珍珠鸟小染色体基因表达的“最优”密码子.对应分析表明,影响珍珠鸟小染色体基因密码子使用的主要因素分别为GC3s、CDS的GC含量基以及因的表达丰度.珍珠鸟小染色体基因的密码子用法受到了基因碱基组成的显著影响,其密码子的偏性是碱基组成及选择等因素综合作用的结果.本研究的目的是系统探究珍珠鸟小染色体基因的密码子用法,探究鸟类基因表达的分子调控机制.

关键词：珍珠鸟、小染色体、密码子偏性

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分类号：Q953.3(动物学)

资助基金：江西省教育厅科学技术研究项目GJJ12658;江西省自然科学基金项目2010GZN0021

在线出版日期：2014-02-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：293-296