10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.05
基于压缩氨基酸和支持向量机进行膜蛋白类型识别
膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,是细胞执行各种功能的物质基础.根据其在细胞膜上的不同存在方式,主要分为六种类型.本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩,再对压缩序列进行氨基酸组成和顺序特征的提取,最后采用支持向量机构建分类模型.通过五叠交叉验证的结果表明,该方法对于六种膜蛋白的分类预测,准确度最高可达98%以上,平均预测准确度在85%以上,可有效实现膜蛋白六种类型的划分,为进一步分析膜蛋白的结构和功能奠定基础.
膜蛋白、压缩氨基酸、支持向量机
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R978.1+6(药品)
宁夏大学自然科学基金ZR1124
2014-02-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共4页
271-274