基于核小体位置预测的酵母进化印迹研究

摘要：

在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响.我们观察到核小体DNA比连接DNA的平均预测准确率低15％,这种普遍存在的局部预测准确率差异性代表了酵母核小体定位的进化印迹(Evolutionary footprint),它揭示了核小体组织在基因组的整个进化过程中所具有的保守性.

关键词：核小体、转录起始位点、预测准确率、进化印记

所属期刊栏目：11

分类号：Q-3(生物科学的研究方法与技术)

资助基金：国家自然科学基金资助项目31160234;云南省应用基础研究计划项目2011FB082

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：150-152,160