DNA序列基于k-字的数值刻画及其应用

摘要：

借助DNA序列中k-字的频数,将序列转化成一个340维向量,进而计算物种间的进化距离.作为应用:分别以15个物种的β球蛋白基因、13种汉坦病毒的S片段以及26个闭壳龟线粒体基因为例,构建系统发生树,所得结果与前人的结论-致,说明了该方法的有效性.

关键词：k-字、340维向量、系统发生树

所属期刊栏目：11

分类号：Q523(核酸)

资助基金：国家自然科学基金项目11171042;辽宁省高等学校杰出青年学者成长计划LJQ2011122

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：142-145