应用PPIN分析肝移植临床耐受患者PBMC基因表达特点

摘要：

应用生物信息学方法分析肝移植临床耐受患者PBMC基因表达特征,筛选临床耐受关键基因.从GEO数据库获取19个肝移植临床耐受病例及22个非临床耐受病例基因表达谱数据.应用DAVID网络软件进行差异基因功能注释与聚类分析；通过Cytoscape软件的MiMI插件构建蛋白质相互作用网络(PPIN)筛选肝移植临床耐受关键基因.差异基因涉及蛋白质及RNA代谢、免疫应答、膜结构调节等复杂生物过程.PPIN网络分析获得10个临床耐受核心基因.我们的研究表明:肝移植临床耐受涉及外周血免疫细胞复杂的基因表达调控机制及蛋白质间相互作用；RNA的转录后加工及蛋白质降解在免疫耐受的形成中发挥了重要作用；RBM8A、DHX9、CBL、IKBKB、CSNK2A1、HSPA8等核心基因发挥重要的免疫调节功能.

关键词：肝移植、临床耐受、基因表达谱、蛋白质相互作用网络

所属期刊栏目：11

分类号：R617;R392.4;Q-332(外科手术学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2009CB522407

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：136-141