GPGPU加速生物序列比对研究进展

摘要：

序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段.生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任.本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件设备与其编程环境,然后对GPGPU做科学计算时需要的数学库函数做一介绍,最后综述近年来国内外基于GPGPU的生物序列比对软件和相关研究工作,并总结和展望其辉煌前景.

关键词：GPGPU、序列比对、数学库函数

所属期刊栏目：11

分类号：Q526;O641(核酸)

资助基金：甘肃省重点实验室建设计划1106RT3A021;甘肃省2012年陇原青年创新人才扶持计划

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：115-119