甘蔗天冬氨酰半醛脱氢酶基因的电子克隆与分析

摘要：

应用电子克隆技术,以水稻EF576477序列为探针,获得了甘蔗天冬氨酰半醛脱氢酶基因(aspartate-semialdehyde dehy-drogenase,ASADH)的一条cDNA全长序列,命名为ScASADH.采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、亚细胞定位、跨膜结构域、疏水性/亲水性、高级结构及功能域等方面进行预测和分析.结果表明:该基因全长1711bp,包含一个1128 bp的开放阅读框,编码375个氨基酸,该基因编码蛋白定位于细胞核,为可溶性蛋白,存在信号肽,二级结构原件多为无规卷曲,含有多个保守功能域,主要功能为翻译.电子表达分析结果显示,该基因在甘蔗根尖、幼苗、花序、叶片和茎中组成型表达,其中在茎中的表达量比其他组织类型中表达量高.该基因的表达受葡萄搪杆菌和赤腐病菌的调控.

关键词：甘蔗、ASADH基因、电子克隆、生物信息学、电子表达分析

所属期刊栏目：11

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金“甘蔗抗黑穗病分子机理及关键基因克隆和功能研究”31101196;现代农业产业技术体系建设专项资金项目“国家甘蔗产业技术体系”CARS-20;福建农林大学杰出青年科研人才基金xjq201202

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：91-99