家蝇小热休克蛋白(sHsp20.6)的生物信息学分析

摘要：

研究家蝇小热休克蛋白sHsp20.6的生物学功能.方法应用生物信息学的方法和工具对家蝇sHsp20.6的理化性质、疏水性、跨膜区和信号肽、膜体分析、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模进行分析.结果表明:家蝇sHsp20.6是一个亲水蛋白,分子量为20.64kD,等电点为5.66,不具有跨膜区和信号肽,包含有一个HSP20的结构域,主要构成原件为α螺旋和无规则卷曲,三维结构预测显示该蛋白为棒状结构,C端结构域具有7个片层结构.聚类分析显示,家蝇sHsp20.6蛋白与昆虫中的直系同源小热休克蛋白(orthologous small heat shock protein)聚为一类.

关键词：家蝇、小热休克蛋白、生物信息学

所属期刊栏目：11

分类号：Q518.2(蛋白质)

资助基金：贵州省科技厅联合基金黔科合[2010]3141,贵州省高层次人才科研条件特助经费867

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：65-71