东方肉座菌EU7-22木聚糖酶和木糖苷酶基因克隆及生物信息学研究

摘要：

东方肉座菌EU7-22具有高产半纤维素酶的能力.根据已报道的同属里氏木霉及绿色木霉木聚糖酶,木糖苷酶相关基因序列,设计PCR引物扩增出东方肉座菌内切木聚糖酶(XYN Ⅰ,XYNⅡ)及β-木糖苷酶(β-BXL)基因.序列经NCBIBlast分析:东方肉座菌xyn Ⅰ基因与里氏木霉xynl基因(X69573.1)的同源性最高达到91％；xynⅡ基因与绿色木霉xyn2基因(EF079061)同源性最高达到93％；β-bxl基因与里氏木霉β-bxll基因(Z69257.1)的同源性最高达到94％.生物信息学分析表明内切木聚糖酶Ⅰ和Ⅱ均属于糖基水解酶家族11,N末端前19个氨基酸均为信号肽.内切木聚糖酶Ⅰ分子量为24.13kD,等电点为7.87,含有3个糖基化位点；内切木聚糖酶Ⅱ分子量为24.44 kD,等电点为4.86,含有1个糖基化位点；β-木糖苷酶属于糖基水解酶家族3,分子量为87.27 kD,等电点为5.49,N末端前20个氨基酸为信号肽,含有8个糖基化位点.利用SWISS-Model对木聚糖酶,木糖苷酶蛋白质三级结构进行了预测和模拟.对木聚糖酶和木糖苷酶基因及其编码蛋白质的生物信息学分析,为进一步研究这些基因的表达与调控、构建高效利用纤维素组份的工程菌株奠定基础.

关键词：东方肉座菌、木聚糖酶、木糖苷酶、基因克隆、生物信息学

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分类号：Q343.1+5(遗传学分支学科)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2010CB732201;中央高校基本科研业务费专项资金201112G026;国家自然科学基金31170067

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：58-64