基于结构的单绕蛋白聚类图构建与分析

摘要：

蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义.本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图.分析发现:功能相似蛋白存在明显聚集现象,同一超家族样本基本聚在一个大支中,同一家族样本集中在所属超家族下的小支中,功能约束下单绕样本聚类图与物种进化图有较好对应关系.结果表明:单绕蛋白的结构演化反映了蛋白质功能的约束,特定功能单绕样本的结构差异具有种属特异性,结构演化包含了物种进化信息.

关键词：单绕、结构比对、系统聚类、物种进化

所属期刊栏目：11

分类号：Q51(蛋白质)

资助基金：北京市自然科学基金4112010;北京市教委科技发展计划面上项目资助

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：44-49