人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列分析

摘要：

本文以人腺病毒B亚种31条基因组序列及D亚种39条基因组序列为研究材料,利用Imperfect Microsatellite Extractor 和DNAMAN软件对这些基因组序列中简单重复序列(SSR)的分布情况进行了系统性分析和比较.分析结果显示:人腺病毒B、D亚种基因组中简单重复序列的平均相对密度是十分接近的,但在不同类型SSR中分布情况又有所不同.D亚种中二型SSR明显高于B亚种,在两亚种一型SSR中(A)n、(T)n都是比较多的,而在两亚种二型SSR中的(CG/GC)n表现出了较高的偏好性.在同亚种多序列比对分析中,D亚种表现出了更高的稳定性.B、D亚种中SSR的这种特异性分布可能与它们的进化机制和致病性有关.

关键词：人腺病毒、亚种、简单重复序列

所属期刊栏目：11

分类号：Q343.1+5(遗传学分支学科)

资助基金：湖南省科技计划项目2008CKI3070;长沙市科技计划项目2011K1113021/11

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：39-43