基因网络相继故障机理分析

摘要：

癌相关基因在疾病发生与发展过程中的作用机理是非常重要的研究课题.现代数据分析方法,为从基因组数据中推断癌相关基因之间的关联,以及分析基因组的作用机理提供了有效的手段.本文根据基因表达谱数据分别建立了正常组织与神经胶质瘤和肾癌的患病组织的基因互信息网络.用以介数为基础的相继故障模型研究了基因网络结构与鲁棒性之间的关系.定义了网络相继故障节点百分比、平均相继故障规模和相继故障规模比例累积概率等衡量网络鲁棒性的结构参数.通过对照组与实验组之间的比对,我们发现实验组网络比对照组网络更加稳定,并将引起网络大规模相继故障的基因称为结构性关键基因.这些结构性关键基因中的一部分已经被证明与神经胶质瘤或肾癌的发生、发展有密切关系.大多数基因被预测在神经胶质瘤和肾癌的发生中起着激励或抑制作用,需要进一步的试验验证.预测信息为研究癌相关基因提供了新的方向.

关键词：系统生物学、基因网络、相继故障、介数、结构性关键基因

所属期刊栏目：11

分类号：Q518.2(蛋白质)

资助基金：The authors would like to thank National Natural Science Foundation of China: 60874036, 61170183;Scientific Research Foundation for the Excellent Middle - Aged and Youth Scientists of Shandong Province of ChinaBS2011SW025;SDUST Research Fund of China2010KYJQ104;SDUST Technology Innovation Fund for Graduate Students of China YCA110417, YCA110415 for the support to this work, and Haixia Zhang to support the data of renal cancer

在线出版日期：2013-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

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