基于一致序列多样性分析的启动子预测方法

摘要：

基于启动子的以下特点:(1)启动子区域有一些一致序列,但对于不同的启动子,一致序列在个别碱基上会有所改变,具有多样性;(2)一致序列的位置并不固定,总是在某个范围内波动;(3)大部分的真核生物启动子都和CpG岛有关.提出了一个新的启动子预测方法,即采用了一种新的统计建模策略,并首次提出了区间位置权重矩阵(IPWM)概率模型.大规模序列测试结果表明,新的启动子预测系统具有较好的敏感性和特异性.

关键词：启动子预测、真核生物、CpG岛、区间位置权重矩阵

所属期刊栏目：10

分类号：TP391(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金61070118

在线出版日期：2012-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：211-216