利用VBA查找核酸数据库DNA保守序列

摘要：

采用VBA编写了查找核酸数据库保守序列的四个相关程序,“导入DNA序列”程序可以将Fasta格式的DNA序列文本文件存放到Excel Sheetl的A列中,保留每个序列的Gi号,删除多余的注释部分；“整理DNA序列”程序可以将DNA序列Gi号存放到A列中,B列为对应Gi号的完整序列；“DNA随机序列”程序可以产生DNA随机序列；“发现DNA保守序列”程序可以将随机序列与下载的DNA序列比对,查找每一种随机序列的出现频率.以大豆基因组序列为实例,说明了这些程序的应用方法.该程序弥补了流行序列比对软件的不足,为PCR设计引物、分析基因功能以及种质资源鉴定等方面提供新的工具.

关键词：VBA、序列比对、保守序列、核酸数据库、大豆

所属期刊栏目：9

分类号：Q518.2(蛋白质)

资助基金：安徽高校省级自然科学研究重点项目资助KJ2008A089

在线出版日期：2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：299-302