乙型肝炎病毒B2和C2亚型中SSRs的比较分析

摘要：

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)属于嗜肝DNA病毒科(hepadnaviridae),它分布在世界各地并严重危害人类的健康.本文从NCBI的GenBank中下载了106条B2亚型和130条C2亚型的基因组全长序列,以下载的数据为材料,分析简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)在B2和C2亚型基因组序列中的分布情况.结果显示,简单重复序列的重复次数比较少；二型简单重复序列在研究的五种简单重复序列类型中占绝对优势；这可能与B2和C2亚型基因组序列有较高的突变率有关.同时还发现最普遍的SSRs、序列间SSRs的平均相对丰度和平均相对密度在B2和C2亚型中分布情况相似.

关键词：简单重复序列、乙型肝炎病毒、亚型

所属期刊栏目：9

分类号：Q518.2(蛋白质)

资助基金：湖南省科技计划项目2008CK13070;十一五支撑计划2006BAD08A13-2

在线出版日期：2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：275-280