细胞色素P450BM3催化正十六烷动力学计算

摘要：

细胞色素P450 BM3作为烷烃羟基化酶,能催化正链烷烃,已被广发研究和应用.利用动力学模拟软件对BM3酶与烷烃底物复合物进行构象、酶的活性位点以及结合能的预测,并通过模拟水以及离子环境下对复合物的影响,从能量及构象位移的角度阐述BM3酶与底物结合的机理,从而用分子动力学观点来解释细胞色素P450催化烷烃机理.用Auto dock等软件将BM3与十六烷对接,发现底物C16与铁原子间距为7.57 ?,并发现与底物结合的活性位点关键残基:ALA 330,ALA 74,SER 72,GLN 73,ALA328,LEU 188,LEU 437.经Gromacs动力学模拟步长为1 ns,温度在298 K,压力为常压1.0,复合物结合稳定.

关键词：细胞色素P450 BM3、正十六烷、底物结合动力学、分子动力学模拟

所属期刊栏目：9

分类号：Q554.1(酶)

资助基金：国家自然科学基金20477002

在线出版日期：2011-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：134-137