链球菌属纤连蛋白结合蛋白的生物信息学分析

摘要：

对链球菌属纤连蛋白结合蛋白进行系统的分析,找出其特征,为以后的研究奠定基础.通过MUSCLE、BLASTP、PSI-BLAST、PHYLIP、Perl编程等生物信息学方法对217条候选纤连蛋白结合蛋白进行研究.发现共有31个序列纤连蛋白结合蛋白重复单元序列模体,绝大部分蛋白由两个或两个以上的不同模体序列构成,其保守结构域组合呈现多样性等特征.表明链球菌属纤连蛋白结合蛋白重复单元序列模体不是严格统一的,总体上具有变异性,但模体之间又有很大的相似性.

关键词：生物信息学、纤连蛋白结合蛋白、链球菌属

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分类号：Q518.2(蛋白质)

资助基金：受"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"科技重大专项:《传染病检测技术研究-传染病病原体诊断和组合检测技术》项目2008ZX10004-002

在线出版日期：2011-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：60-64