甲型流感病毒HA基因的简单重复序列分布分析

摘要：

以GenBank公开的甲型流感病毒亚型的血凝素(hemagglutinin,HA)核苷酸序列为材料,从简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分布的分析角度出发,分析了来自于亚洲、非洲、北美洲、南美洲、欧洲、大洋洲的49个地区的76株甲流病毒的HA片段.分析表明:所分析序列的SSRs的分布都很相似,其中单碱基重复的相对丰度值和相对密度值均高于其它五种碱基重复的相对丰度值和相对密度值;甲流病毒HA片段的SSRs与HIV-1[16]基因中的SSRs相比,前者的相对丰度值和相对密度值高于后者.这些结果表明甲流病毒基因中的SSRs可能与甲流病毒的快速变异相关.

关键词：甲型流感、简单重复序列、血凝素

所属期刊栏目：9

分类号：R371.13(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：湖南省自然科学基金07JJ5085;湖南省科技计划项目2008CKI3070

在线出版日期：2011-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：54-59