基于打分矩阵的多类蛋白质折叠子的预测

摘要：

依据蛋白质折叠子中氨基酸保守性,以氨基酸、氨基酸的极性、氨基酸的电性以及氨基酸的亲-疏水性为参数,从蛋白质的氨基酸序列出发,采用"一对多"的分类策略,通过构建打分矩阵和选取氨基酸序列模式片断,利用5种相似性打分函数对27类折叠子进行识别,最好的预测精度达到83.46%.结果表明,打分矩阵是预测多类蛋白质折叠子有效的方法.

关键词：打分矩阵、相似性打分函数、蛋白质折叠子、氨基酸的保守指数

所属期刊栏目：9

分类号：Q518.2(蛋白质)

在线出版日期：2011-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：42-45,49