人类基因组上CpG岛的定位和系统分析

摘要：

为了研究CpG岛产生和消失机制以及位于基因启动子区域外的CpG岛保守性等问题,我们通过序列比对和进化保守性分析等方法,分析在人类和小鼠中保守的基因上的CpG岛.结果显示已有保守序列的突变以及序列插入删除是CpG岛产生和消失的主要原因,进一步分析发现52%的在小鼠基因组上保守序列完全缺失的CpG岛位于两个转座子之间,提示转座子所介导的序列插入是CpG岛形成和消失的重要原因.人类基因组上在启动子区域外的CpG岛中约有79%为新产生的CpG岛,显著高于启动子区域内新产生的CpG岛比例 (41%).GO分析表明与这些CpG岛相关的部分基因与神经系统发育显著相关,提示新产生的CpG岛参与神经发育过程.

关键词：CpG岛、进化保守分析、CpG岛起源、转座子

所属期刊栏目：8

分类号：Q811.4;Q62H30;Q92BO5(生物工程学(生物技术))

资助基金：教育部创新团队发展计划项目IRT0453

在线出版日期：2010-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：254-257,262