面向新一代基因组测序技术的序列拼接算法

摘要：

随着新一代测序技术的发展,新的拼接算法应运而生.介绍了目前国际上广泛认可的几种新的拼接算法的基本原理与具体步骤,分析每种算法的优缺点以及适用范围.用Helicobacter acinonychis的Illumina 1G测序数据检测SSAKE,VCAKE,SHARCGS以及velvet的性能,并对未来拼接算法的研究提出展望.

关键词：基因组测序、序列拼接、短片段

所属期刊栏目：8

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金60671018

在线出版日期：2010-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：248-253