基于Petri网T不变量的PHB新陈代谢建模分析

摘要：

从拓扑结构的角度分析生化反应网络是生物信息学研究中的一个热点问题.通过将两种传统的途径分析方法(基元模式和极端途径)与Petri网的T不变量分析进行了比较,结果表明:它们本质上是一致的,但是采用Petri网的T不变量分析更便捷.然后,利用Petri网技术构建了PHB代谢模型.对该模型作了结构分析,将计算得到的23个T不变量进行了分组:I组表示简单的可逆反应,II组表示循环的反应,III组可用于调控ATP/ADP比率,IV组是与PHB生产直接相关的反应,可用于代谢工程以提高PHB的产率.最后讨论了Petri网的T不变量分析在这个领域中的应用.

关键词：不变量分析、代谢网络、Petri网、系统生物学

所属期刊栏目：8

分类号：Q5;TP339

资助基金：安徽省教育厅自然科学研究项目KJ2009B233Z,KJ2010B133;池州学院引进研究生项目XYK200809

在线出版日期：2010-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：240-244