PCR引物特异性核查系统(PSC)的构建与应用

摘要：

聚合酶链式反应(PCR)虽已广泛用于分子生物学研究中,然而PCR实验中的非特异性产物问题将直接影响PCR的效率,在多重PCR实验中更是如此.为了最大限度地降低非特异性产物的出现率,同时避免用户频繁使用Blast比对检查非特异性,我们开发了基于NCBI-Blast的引物评估和模板DNA特异性结合能力评估的核查系统PSC(Primer Specificity Checking,http://biocompute.bmi.ac.cn/PSC),并基于虚拟PCR实验确定了用于引物质量核查计算的多种参数,能够在线提供多个物种的引物特异性核查结果.该系统可以有效地对引物序列可能产生的所有非特异性扩增进行预测,有助于实验前引物优化或者对非特异扩增结果进行解释,最终达到提高PCR效率的目的.

关键词：引物、引物对匹配指数、引物特异性、多重PCR

所属期刊栏目：8

分类号：Q7(分子生物学)

资助基金：国家重点基础研究发展规划项目973计划2006CB504100,2003CB715900;国家自然科学基金30771230,30772293项目

在线出版日期：2010-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：134-138,141