Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

摘要：

利用FreeBSD操作系统的文本过滤命令将NCBI的Genbank数据库的EST序列实现本地化导入到MySQL数据库中并能够进行更新,这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析.以水稻EST数据为例,对EST序列两端出现的polyA/T和载体序列亦进行了鉴别及去除,经过预处理的EST序列数据将为进一步进行EST聚类及基因表达分析提供可靠的保证.

关键词：EST、MySQL数据库、更新、预处理分析

所属期刊栏目：8

分类号：TP392;Q343.1(计算技术、计算机技术)

在线出版日期：2010-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：52-56