Tup1突变对转录抑制局部网络中基因表达的非线性影响

摘要：

研究基因网络的非线性行为特征是研制基因网络技术的基础.Tup1基因是酵母中作用最为广泛的转录抑制因子之一,利用酵母生物信息学数据库中蛋白相互作用关系,构建一个以Tup1为中心,4个层次741个基因的局部基因网络.统计分析六张Tup1不同突变的基因表达芯片数据,将局部基因网络中的全部基因按照3个网络特征进行统计分析:必需\非必需基因、网络层次和网络节点,并研究这些特征与基因表达之间的关系.初步发现基因表达变化的强度与节点数目成一定的反比关系,必需基因的平均变化程度较非必需基因为低,且由Tup1突变引发的其他基因的表达变化在以Tup1为中心的局部基因网络中近层次网络变化程度较大,远层次网络变化程度较低.

关键词：局部基因网络、基因表达变化、非线性、Tup1基因

所属期刊栏目：7

分类号：Q754(分子遗传学)

资助基金：教育部新世纪优秀人才计划2006;国家自然基金30570401

在线出版日期：2010-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：272-276