支持向量机方法预测蛋白质结构中的二硫键

摘要：

在蛋白质结构预测的研究中,一个重要的问题就是正确预测二硫键的连接,二硫键的准确预测可以减少蛋白质构像的搜索空间,有利于蛋白质3D结构的预测,本文将预测二硫键的连接问题转化成对连接模式的分类问题,并成功地将支持向量机方法引入到预测工作中.通过对半胱氨酸局域序列连接模式的分类预测,可以由蛋白质的一级结构序列预测该蛋白质的二硫键的连接.结果表明蛋白质的二硫键的连接与半胱氨酸局域序列连接模式有重要联系,应用支持向量机方法对蛋白质结构的二硫键预测取得了良好的结果.

关键词：蛋白质结构预测、二硫键、支持向量机、LIBSVM

所属期刊栏目：7

分类号：Q516(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金60671025,60474065;国家科技部高新技术计划项目2005EJ000017

在线出版日期：2010-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：261-263