山羊不同组织来源EST片段的生物信息学分析

摘要：

利用生物信息学方法,对GeneBank中截至2006年9月收录的全部来源于山羊基因的共计637条表达序列标签(EST)进行了综合及分类分析.结果显示,在来源于绒山羊舍毛囊皮肤的392条EST序列中有48条为编码角蛋白或角蛋白关联蛋白的基因;在乳腺来源的245条EST中则无此类基因,而是如免疫球蛋白基因、维生素转运蛋白基因、MHC等诸多种类基因,以免疫和酶类居多.两类不同组织来源的EST相应基因相似之处最显著的是编码核糖体蛋白的基因,其中含毛囊皮肤组织的EST中有15.1%,乳腺组织为21.6%,并且有两种不同组织来源的EST组成的26条基序(contigs)中,编码核糖体蛋白的有17条,高达65.4%.

关键词：山羊、表达序列标签(EST)、生物信息学

所属期刊栏目：6

分类号：Q344.(遗传学分支学科)

资助基金：河北省自然科学基金C200500241;河北农业大学校科研和教改项目

在线出版日期：2008-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-17,27