10.3969/j.issn.1672-5565.2007.03.006
大肠杆菌E.coli K-12转录因子结合位点的理论预测
基于实验验证的22种大肠杆菌K12的转录因子结合位点序列,分析了转录因子结合位点每一位置的碱基保守性,提出了预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数算法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validation两种检验方法对此算法进行检验,self-consistency检验总的预测成功率达到87.59%,cross-validation检验成功率达到85.48%.对基因间序列进行搜索,获得了多个可能的转录因子结合位点.
转录因子结合位点(TFBS)、位置权重矩阵(PWM)、碱基保守性
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Q61(理论生物物理学)
国家自然科学基金30560039
2007-11-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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117-120