大鼠尿激酶SYBR Green I real time RT-PCR引物的设计

摘要：

设计用于SYBR Green I法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT-PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物.从基因库获取靶基因及相关序列,充分收集和分析相关生物信息学数据,应用Oligo 6.22设计出一对长度为21bp的引物,其GC含量为52.4%;上下游引物3'最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1.5、-0.40 kcal/mol和-3.5、-0.90kcal/mol,引物间最稳定二聚体为-3.1 kcal/mol.5'端和中间△G值较高,高于3'端△G;引发效率分别455和403.实验证明,该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测,适用于 SYBR Green I法实时定量检测(uPA)mRNA.

关键词：引物设计、生物信息学、软件

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分类号：Q959.837;Q78(动物学)

资助基金：国家科技攻关计划2004BA720A33-1

在线出版日期：2007-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：53-57