NGAL基因不同长度片段的克隆及其顺式作用元件定位分析

摘要：

NGAL(neutrophil gelatinase-associated lipocalin)是lipocalin家族的一个新成员,可能是人类的一种新癌基因,但其在肿瘤中的表达调控机制尚不清楚.应用生物信息学手段对NGAL(X99133,包括外显子和内含子)进行分析发现,此区域内含有许多潜在的顺式作用元件,其中主要为增强子元件.对此设计了以下实验:应用PCR技术从食管癌细胞SHEEC基因组DNA中扩增不同长度的NGAL基因片段,将其连接到PGEMT-eacy载体中进行扩增,并测序.NCBI/BLAST分析确认扩增片段为NGAL基因所有,与实验所设计相吻合.在此基础上并应用KEGG/MOTIF检索分析系统对NGAL基因的上述区段进行了顺式作用元件定位分析,结果共鉴定出5个Score值=100分的顺式作用元件位点.这为NGAL基因增强子的鉴定提供了新线索.

关键词：NGAL基因、顺式作用元件、生物信息学、食管癌细胞

所属期刊栏目：3

分类号：R735.1;Q343.1+2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金39900069,30170428,30370641;广东省自然科学基金37788;广东省自然科学基金990799,010431

在线出版日期：2005-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：53-57