水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆

摘要：

采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长1611bp的cDNA序列,以此为信息探针搜索HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列--OSJNBa0057G07克隆.用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含14个外显子和13个内含子的基因.该基因位于水稻第3染色体物理图谱的136.0～137.6cM区域.推导的ORF编码498个氨基酸,经BLASTP搜索SWISS-PROT数据库和蛋白序列的亚细胞定位显示,该基因编码水稻的线粒体丝氨酸羟甲基转移酶(mSHMT).该基因受到EST序列的完全支持,其中不乏来自盐胁迫、稻瘟病菌侵染等逆境处理的EST序列,推测该基因与水稻对逆境的应答反应有关.

关键词：水稻、线粒体丝氨酸羟甲基转移酶、电子克隆

所属期刊栏目：3

分类号：S511(禾谷类作物)

在线出版日期：2005-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：5-9