抑制剂Amprenavir与HIV-2蛋白酶作用机制的分子动力学研究

摘要：

HIV-2蛋白酶已成为治疗艾滋病的一个重要药物靶标.作者采用分子动力学模拟并结合自由能计算,研究了抑制剂Amprenavir (AMP)与HIV-2蛋白酶的作用机制.研究结果表明范德华作用是AMP与HIV-2蛋白酶结合的主要力量.采用基于残基的自由能分解方法计算抑制剂-残基相互作用,结果表明疏水性的CH-π和CH-O相互作用驱动了抑制剂AMP与HIV-2蛋白酶的结合.作者期望这一研究结果能为抗艾滋病双重抑制剂的研发提供一定的理论指导.

关键词：HIV-2蛋白酶、分子动力学、分子力学/泊松-波尔兹曼表面积方法、结合自由能

所属期刊栏目：30

分类号：Q61(理论生物物理学)

资助基金：国家自然科学基金项目11104164,11274206和31200545;山东省自然科学基金项目ZR2011HM048;山东交通学院博士启动资金和校自然基金;grants from The National Natural Science Foundation of China11104164,11274206 and 31200545;The Natural Science Foundation of Shandong ProvinceZR2011HM048;Dr.Start-up Foundation of Shandong Jiaotong University and Natural Science Foundation of Shandong Jiaotong University

在线出版日期：2014-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：47-54