蓝藻非编码RNA Yfr7的生物学特征分析

摘要：

Yfr家族是广泛存在于蓝藻基因组中的一类非编码RNA,在细胞代谢和环境适应方面发挥重要作用.文中选取Yfr7作为研究对象,首先根据序列特征确定Yfr7的二级结构,然后结合动态规划和自由能的计算方法预测Yfi7的调控基因,从细胞定位、分子功能和调控路径三方面对这些基因进行分析,以快速发现Yfr7的功能,最后通过构建进化树来揭示Yfr7的遗传特征.结果表明:Yfr7拥有独立的启动子区和操纵子,通过保守片段5'-GTGCTCTGATCTGACT-3'与目标mRNA序列互补来调控特定基因的表达;目标基因包括看家基因和酶基因,这些目标基因的功能说明Yfr7广泛参与细胞的次级代谢;进化树聚类表明Yfr7与菌株光照类型有关,参与蓝藻最重要的光合反应;Yfr7与6S RNA在序列、结构和遗传距离上都高度一致,推测可能来自同一个祖先.这些研究结果可为进一步开展相关实验研究提供理论基础.

关键词：蓝藻、Yfr7、调控、分子功能、进化

所属期刊栏目：30

分类号：Q74(生物小分子的结构和功能)

资助基金：国家自然科学基金项目81171411;四川省科技支撑计划项目2011FZ0034;grants from The National Natural Science Foundation of China81171411;The Key Technology Research and Development Program of Sichuan Province2011FZ0034

在线出版日期：2014-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：24-34