DNA甲基化的重要特征

摘要：

目前,预测和分析DNA甲基化的研究所用的特征存在差异,缺少统一比较和评价,对非CpG岛序列缺少分析.为了进行统一比较和评价,作者集成DNA甲基化的主要特征,对CpG岛和非CpG岛序列进行分析,鉴别特征的重要性,并利用特征选择技术识别紧凑的特征子集.结果表明,序列模式和组蛋白修饰都是关联DNA序列甲基化的重要特征但并不独立,两者结合共同参与维持序列的甲基化模式；H3K4me3同时是CpG岛序列和非CpG岛序列最重要的组蛋白特征,具有最高的识别频率.本文标识DNA甲基化的重要特征在生物学上具有重要功能,可以作为线索来研究DNA甲基化、组蛋白修饰和基因调控间的关系.

关键词：DNA甲基化、CpG岛、特征选择、分类、支持向量机

所属期刊栏目：28

分类号：Q6-33;TP391

资助基金：国家自然科学基金项目60903086,11126090,61070127

在线出版日期：2013-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：910-922