生物大分子的自由能计算方法

摘要：

在本文中,我们总结了计算生物物理中广泛使用的经典的自由能计算方法,主要可以归纳为三大类:第一类是基于过渡态理论,利用路径系综得到自由能的方法;第二类方法采用一些经验势来补偿自由能表面达到均匀采样的目标;最后一种是将整个转换径分段计算,然后拼接完成得到完整自由能的方法.通过详细介绍自由能计算的重要性和实施细节,希望能够让读者对该方向有一全面了解.

关键词：自由能、约束势、优化路径、分子动力学

所属期刊栏目：27

分类号：Q71(生物大分子的结构和功能)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2011-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：395-402